Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FSCN1Q16658 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms