Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDK4Q16654 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms