Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTRK2Q16620 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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