Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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SSX1Q16384 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSX1Q16384 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSX1Q16384 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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