Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
E2F4Q16254 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2F4Q16254 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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