Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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SNCBQ16143 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNCBQ16143 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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