Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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GRIK4Q16099 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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GRIK4Q16099 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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GRIK4Q16099 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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GRIK4Q16099 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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GRIK4Q16099 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GRIK4Q16099 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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GRIK4Q16099 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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GRIK4Q16099 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GRIK4Q16099 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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