Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMD6Q15008 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms