Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GAPVD1Q14C86 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GAPVD1Q14C86 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GAPVD1Q14C86 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
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