Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO1Q147U7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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