Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A3Q14050 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A3Q14050 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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