Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CBFBQ13951 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CBFBQ13951 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms