Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNTB1Q13884 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNTB1Q13884 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms