Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SCGB2A2Q13296 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SCGB2A2Q13296 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SCGB2A2Q13296 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCGB2A2Q13296 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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