Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SRSF6Q13247 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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