Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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IFT88Q13099 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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IFT88Q13099 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IFT88Q13099 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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