Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRPL28Q13084 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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