Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP1Q12981 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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