Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ANK3Q12955 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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