Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RIPPLY1Q0D2K3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms