Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TGM3Q08188 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms