Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX4Q06945 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX4Q06945 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms