Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FMODQ06828 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FMODQ06828 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FMODQ06828 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FMODQ06828 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FMODQ06828 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FMODQ06828 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FMODQ06828 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FMODQ06828 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FMODQ06828 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms