Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBQ06643 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LTBQ06643 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LTBQ06643 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms