Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSBP1Q04837 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSBP1Q04837 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms