Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GBE1Q04446 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.6 ms