Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FANCCQ00597 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms