Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GNB1P62873 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GNB1P62873 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GNB1P62873 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms