Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2MP61081 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms