Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAD23AP54725 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAD23AP54725 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms