Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP1B3P54709 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP1B3P54709 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms