Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV1P50549 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ETV1P50549 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms