Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRB2P47870 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB2P47870 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB2P47870 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB2P47870 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB2P47870 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB2P47870 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB2P47870 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRB2P47870 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms