Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FDFT1P37268 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FDFT1P37268 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms