Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARGP37231 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARGP37231 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARGP37231 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARGP37231 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARGP37231 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARGP37231 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARGP37231 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARGP37231 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PPARGP37231 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PPARGP37231 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms