Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms