Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
HOXD13P35453 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD13P35453 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms