Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNB1P35222 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms