Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MARCKSP29966 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MARCKSP29966 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms