Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E2P29084 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E2P29084 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms