Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PLNP26678 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PLNP26678 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLNP26678 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLNP26678 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms