Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTNNA2P26232 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms