Protein–RNA interactions for Protein: P17181

IFNAR1, Interferon alpha/beta receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNAR1P17181 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNAR1P17181 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNAR1P17181 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms