Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB4P16144 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB4P16144 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms