Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTMAP06454 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTMAP06454 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms