Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT18P05783 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT18P05783 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT18P05783 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT18P05783 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT18P05783 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT18P05783 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT18P05783 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT18P05783 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT18P05783 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT18P05783 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT18P05783 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT18P05783 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT18P05783 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT18P05783 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms