Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COL4A1P02462 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL4A1P02462 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms