Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBE1P02100 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms