Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EGFRP00533 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EGFRP00533 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGFRP00533 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGFRP00533 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGFRP00533 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGFRP00533 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms