Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms